Sebuah pesan telah tiba dari Kid si Pencuri Hantu, bahwa ia akan mencuri pedang Jepang milik Keluarga Onoe yang kaya di Hakodate, Hokkaido. Conan dan Heiji Hattori, yang kebetulan berada di Hakodate, sedang menyelidiki kasus tersebut untuk menangkap Kid. Secara kebetulan, pengacara keluarga Onoe ditemukan terbunuh di distrik pergudangan, tampaknya dibantai oleh pedang Jepang. Tersangka adalah seorang investor/pedagang senjata yang dikatakan mengincar harta karun tersembunyi keluarga Onoe. Di Utara di antara bunga sakura, perburuan harta karun yang mengasyikkan dimulai!