Agen federal AS Leon S. Kennedy menyelinap ke "Republik Slavia Timur" untuk memverifikasi rumor bahwa Senjata Bio-Organik (BOW) digunakan dalam perang saudara di negara tersebut, yang mana AS dan Rusia sedang bersiap untuk melakukan intervensi bersama. Tepat setelahnya infiltrasinya, pemerintah AS memerintahkan dia untuk segera pergi. Bertekad untuk mengungkap kebenaran, Leon mengabaikan perintah tersebut dan memasuki medan perang untuk mengakhiri rantai tragedi yang disebabkan oleh BOW.